حيث قامت فرقة مكافحة الإرهاب صباح اليوم الأحد، 15 ماي 2016، في ساعة مبكرة بعملية تنزيل على منزل المحجوبي والقبض عليه بعد أن تمّ العثور على بصماته بمسرح الأحداث الإرهابية بالمنيهلة.
وأكّد زميله بالوكالة ذاتها ياسين القايدي أنّ العربي محجوبي كان قد قام بتغطية صحفية للقناة يوم اندلاع الأحداث وتواجد بالمكان وهو ما يرجّح سبب وجود بصماته.