وأضاف الوزير في تصريح له على موجات راديو كلمة، أن برنامج وزارة الشؤون الدينية الذي ستعلن عن كل نقاطه غدا في ندوة صحفية، ذو بعد فكري وثقافي وعلمي، وتسعى الوزارة إلى التركيز على ما من شأنه أن يغير "الفكر الارهابي" الذي انتشر في البلاد لدى شريحة من الشباب التونسي.
كما أكد محمد خليل أن ملف المساجد الخارجة عن السيطرة "ليس مرتبطا بجامع بعينه بل يتعلق بقرابة 5400 جامع ونحن لا نملك عصا سحرية لاسترجاع المساجد الخارجة عن السيطرة بين ليلة وضحاها" مشيرا إلى أنه تم استرجاع الجوامع والمساجد التي لم تتعلق بها مشاكل واشكاليات كثيرة مع الحفاظ على استقلالية الخطب الدينية ومعتبرا أن تفقد الجوامع ومراقبة ما يوجد داخلها وما يخزن فيها هو من اختصاص الأمن.